Pektin je střevní prebiotikum ze skupiny polysacharidů, které končí nestrávené v tlustém střevě. Nejde tedy o cukr v běžném slova smyslu. Pektin je rozpustná vláknina a je využívána mnoha prospěšnými střevními bakteriemi jako potrava, proto pektin patří do skupiny prebiotik. Prebiotický efekt spočívá v tom, že prospěšné bakterie pektin metabolizují a tím získávají energii – což dělá dobře střevní flóře.

Pektin je ve vodě rozpustná vláknina, která může snížit hladinu cholesterolu. Váže se na žlučové kyseliny ve střevě, se kterými se vyloučí stolicí. Protože tělo potřebuje nové žlučové kyseliny na trávení tuku, což vyžaduje tvorbu cholesterolu, cholesterol se opět používá na tvorbu nových žlučových kyselin a tím hladina cholesterolu klesá.